7/15、16、23の土岐先生の実習では、シロイヌナズナを使ったDNAマーカーのジェノタイピングと遺伝子の連鎖解析を行いました。
シロイヌナズナのColumbia 0 (Col0)系統とLandsberg_erecta(gl1-1)(Ler)系統を掛け合わせたF2集団を使いました。
シロイヌナズナには「トライコーム」という透明なトゲのような毛が生えるものがあります。
この毛は葉に見られ、植物を食べる虫などの天敵から身を守る役割をしています。
(塩尻先生の実習で、青虫がトライコームを避けている動画を見せてもらいました!)
Col0系統はトライコームがある系統です。
Ler系統は、GL1遺伝子というトライコーム形成を制御する転写因子が変異しています。
そのせいで、トライコームがなくなっている系統です。
ちなみに、変異遺伝子は小文字で表記されます。
この2系統を掛け合わせて作られたF2集団の中では、トライコームはGL1遺伝子が元の型(野生型といいます)なのか、変異型なのかによって決まります。
GL1遺伝子は顕性のため、F2集団ではメンデルの遺伝法則に従って3:1でトライコームあり:トライコームなしが出現します。
このトライコームあり/なし判定は、植物を育てて葉を観察すればわかります。
でも、発芽してすぐに調べることができたら、育てる前にわかって便利だと思いませんか?
それを可能にするのが、DNAマーカー(本実習ではPCRマーカー)です。
実習では、植物からDNAを簡易抽出し、3種のPCRを行いました。
PCR産物を電気泳動して、ゲル撮影を行います。
生命実習の最初の方に、古本先生の実習で行いましたね。
皆さん手際よく作業しています。
あれ?ゲル割れた・・?
PCR結果はどうでしょうか?
これらの意味を考えて、レポート作成を行います。
実習では最後に、Col0系統とLer系統で分離する花の形についても調査しました
Col0系統は総状に、Ler系統は散房になります。
F2集団で、トライコームの有無と花の形を調べて、どのタイプが何個あるか全班のデータを集計しました。
遺伝の法則に従って、形質が現れることを確認できました。
今回も土岐研究室の学生さんお二人が活躍してくれました。
(辻村)