基礎演習I_キャリア講演会(12/1)

 植物生命科学科では、12月1日(水)、2回生向けの基礎演習Iでお二人の企業若手研究者を招いてのキャリア講演会を行いました。


丸山 望 氏 (下写真・左)

クミアイ化学工業株式会社 研究開発本部生物科学研究所農薬研究センター病害防除研究室


加野 彰人 氏 (下写真・右)

タキイ種苗株式会社 研究農場 病虫害研究グループ 研究員

(講演順)

実はこのお二人には今年、前期3回生向けの基礎演習IIで、農業に関わる企業での研究職紹介として一度ご登壇いただいたことがあります。

https://www.ryukoku.ac.jp/nc/news/entry-8802.html

https://ryukokuagr.blogspot.com/2021/07/iii.html


その時の3回生からの感想として、「これまで授業で習った内容が企業での研究に直結していることがよくわかった」や「授業内容をもう一度復習したい」といった、大学での授業内容がいかに企業で重要な知識・技術なのかに気づいたものが多かったことが印象的でした。そこで教員でも相談をして、もう少し早いうちにそのようなことを気づく機会を持ってもらおうと、2回生向けに同じお二人に再度ご依頼をして、ご快諾いただきました。


同じ年に2回もご講演いただくという異例の事態でしたが、お二人とも2回生向けによりわかりやすい語り口で、前期とは異なる内容を織り交ぜつつ、農薬や品種の開発に関してご紹介いただきました。丸山氏からは、ともすればネガティブな印象を持ちがちな農薬というものを製造販売する会社が掲げる農業への高い理念や、一つの薬剤を売り出すまでにどれほど細かくその作用機構や安全性に関する研究が行われているかという話題をご紹介いただきました。続いて、加野氏からは、新品種育種に向けた現場でどのような技術革新が行われ、また、それらが大学で学ぶ遺伝学や分子生物学といった分野と直結している様子をご紹介いただき、近年、話題のゲノム編集技術を取り巻く国内外の政策・事情にも言及していただきました。つい先日、基礎生物学実習で学んだばかりのDNAのゲル電気泳動が、育種研究で用いられている様子もご紹介いただきました。


もしかすると、2回生には少し早く、少し難解な内容かもしれないという教員の心配をよそに、受講生はみな非常に熱心に聞き入っていたようです。講演後の感想からも授業で学ぶ内容の意義や重要性に気づいたり、就職(特に研究職)に関して深く考える良い機会となったようです。特に、質疑応答で講師の先生から出た「海外を相手にしない仕事はないと言ってもいいし、研究室で読む論文も英語ばかりなので、英語だけは早くからしっかり勉強しておいた方がいい」という言葉が心に響いた学生が多かったようです。2回生のみなさんにとって何かしら良い影響を与える機会になっていればと思います。"You, Unlimited"です!





(別役)


JT生命誌館 研究員レクチャー

 「植物の香りは誰を誘う?ー植物が結ぶ植食者と寄生バチの関係ー」

2021年12月18日(土)

14:00~15:30

JT生命誌研究館展示ホール にて


塩尻が植物と昆虫の匂いを介した関係について一般向けに話をします。是非お越しください。

詳しくは以下

https://www.brh.co.jp/event_lecture/detail/793




基礎生物学実習(11/22,11/29)

今回の2回生の基礎生物学実習は「Excelでのデータ解析と統計解析」(担当教員:小野木先生)でした。表計算ソフトのExcelを用いた、実験結果をはじめとするデータの操作および解析手法の基礎を身につけます。統計は、実験結果から得られたデータを扱う際に必須のツールです。


各自のパソコンやタブレットで演習を行いました


初回はExcelでのデータ操作を行いました。Excelの基本的な操作の確認と、関数の使い方を演習しました。関数を使いこなせるとExcelの利用の幅が大きく広がります。問題演習を通して、まずは条件分岐の関数の入力までをこなせるようになりました。


2回目はExcelでの統計検定を行いました。統計には大きくわけて、記述統計と推測統計があります。記述統計はデータをグラフや数値で分かりやすく表示することをいいます。推測統計はデータからデータが得られた集団(母集団)について何らかの推測を行うことをいいます。 


実験結果が得られたらまずは概要を知ることが重要ですが、多くの数値で示された結果から概要を知ることは難しい場合が多いです。そういった場合はグラフによるデータの可視化が有用になるため、代表的なグラフとExcelでの作成方法を演習しました。例えば、度数分布(ヒストグラム)は観察値がどのように分布しているか知ることができ、箱ひげ図は観察値がどの程度ばらついているかが分かります。

また、仮説検定という手段を用いて、その結果が偶然によるものか、意味のあるものか検証される必要があります。「本当は差がある・差がない」といった仮説に対して、得られた実験結果から仮説の妥当性を検証する科学的手段を仮説検定といいます。仮説検定は推測検定の一つで、正規分布の性質や不偏分散を用いて仮説検定を行います。今回はExcelでのt検定(t分布を用いた検定)までを演習しました。


実習の最後には、今回学んだvlookupなどの関数を応用する課題が出されました。皆、苦戦しながらも自分で考えて、正しい関数を入力することができました。

(中田)

 

基礎生物学実習(11/15, 11/16)

 11月15日、16日の基礎生物学実習では、植物からのDNA抽出と、DNAの分子量マーカーの作成を行い、電気泳動で検出しました(担当:土岐先生)。

 

材料にはブロッコリーの花序(普段食べている蕾の部分)を用いました。

組織を液体窒素で凍らせて粉末状にすり潰し、そこに界面活性剤(CTAB)を加えたDNA抽出液を加えます。

すり潰すことで細胞壁が破壊され、界面活性剤によって細胞膜や核膜が破壊されて、DNAが溶液中に溶け出てきます。

この溶液から余分なタンパク質を除去するために、クロロホルム・イソアミルアルコール混合液を加えて遠心分離を行いました。


この上の層にDNAが含まれています。ピペットマンを使い、上層だけを回収するのですが、上手くできたでしょうか?

 

回収した上層の溶液にイソプロパノールを加えると、DNAが現れます。


DNAは極性を持つ分子です。つまり水に溶ける性質です。

そこにアルコール(ここではイソプロパノール)を加えることでDNAを析出させるのですが、アルコールを加えただけでは、DNA分子中の-電荷が反発しあって析出しません。+電荷をもつ塩の存在下では、電荷が中和されて析出が生じます。

今回はたくさんの材料で実験を行ったので、チューブ内でこのような析出したDNAを見ることができた班も多かったのではないでしょうか?

生物の設計図をこのように目で見ることができるのは、毎回感動しますね。


得られたDNAをTEに溶かし、分光光度計で濃度測定を行いました。



次の実験では、ラムダファージというウイルスのDNAを、DNAを切断する酵素(制限酵素)で切ってDNAサイズマーカーを作りました。

制限酵素は数塩基程の特定のDNA配列を認識して切断します。

また認識する配列は酵素によって異なり、今回はHindIII(AAGCTTを認識)とEcoRI(GAATTCを認識)を使いました。

この酵素処理によって長いDNAがぶつぶつと切れて、大きさの違う数本のDNA断片になります。

ラムダDNAはその全配列が解読されていますので、酵素で切った時に得られるDNA断片の大きさや本数が予測できます。

このように作成したサイズマーカーを電気泳動で自分のサンプルと並べて流すことで、DNA断片のサイズの指標として利用できるのです。


初めての電気泳動でゲルの作成や、ゲルの穴(ウェル)にサンプルを入れるアプライ作業に緊張しましたが、事前に動画教材を視聴してもらったおかげでスムーズに進めることができました。

実験グループごとに泳動バッファーの種類とゲルのアガロース濃度を変えて、どのような差が出るのかを調べました。


                                    (辻村)


 

香川ゼミ調査実習(第一弾)南山城村

 2021年11月24日

香川ゼミの調査実習第一弾です。

今回は京都府南山城村を訪問しました。南山城村では特産品である茶の加工品を道の駅で販売することをとおして、村への訪問客や交流人口を増やす取り組みを行っています。


その取り組みの背景や効果、ご苦労なさった点や今後の展望について、南山城村役場と加工品の生産販売を手掛ける株式会社南山城でヒアリングを実施しました。


参加者は、南山城村を事例として都市農村交流に関する卒論を書いている4回生1名と調査のイロハを学ぶために同行した3回生6名、引率教員1名です。

調査で一番大切なことは事前の準備です。学生達は、実際に調査に出かける前に長い時間をかけて下調べをし、質問項目を作り上げました。

当日は、引率教員は基本的に何も口出しせず、調査のすべてを学生に任せました。

しっかり準備していたので、あまり心配していませんでしたが、実際に上手く調査を成し遂げてくれました。


食料農業システム学科の研究・学修にとって調査を実際に体験し、現場で生の声を聞いて情報を得ることはとても貴重です。よい経験になったと思います。

調査にご協力いただいた皆様、本当にありがとうございました。(香川)